Синтез олигонуклеотидов - это процесс создания коротких цепочек ДНК или РНК, состоящих из нескольких нуклеотидов, которые могут быть использованы в качестве искусственных нуклеотидных последовательностей. Олигонуклеотиды химически синтезируются путем последовательного присоединения нуклеотидов к растущей цепи, таким образом создавая произвольные последовательности нуклеотидов.

Олигонуклеотидный синтез начинается с выбора последовательности нуклеотидов, которую нужно синтезировать. Затем в автоматическом синтезаторе нуклеотиды добавляются один за другим в нужном порядке, пока не будет синтезирована полная цепочка олигонуклеотида.

Наиболее распространенным подходом к синтезу олигонуклеотидов является автоматизированный фосфорамидитный (аминофосфатный) синтез, в котором используются нуклеотидные фосфорамидитные мономеры, защищенные кислотолабильными группами. Активирующий агент связывает каждый мономер с растущим олигонуклеотидом на твердой подложке. После каждого этапа сочетания окисление превращает нестабильную фосфитную связь в фосфат, затем этап деблокирования подготавливает олигонуклеотид к следующему циклу. По завершению всех циклов олигонуклеотид с заданной последовательностью отщепляется от твердой подложки.

Олигонуклеотиды используются в качестве праймеров для полимеразных цепных реакций (ПЦР) и в качестве зондов для различных методов гибридизации.

Праймеры необходимы для инициации синтеза новой цепи при полимеразной цепной реакции. Если подобрать комплементарный праймер для ДНК/РНК мишени, то добавление ДНК-полимеразы в реакцию приведёт к последовательному присоединению нуклеотидов, комплементарных матричной цепи.

Ключевым преимуществом синтетических олигонуклеотидов является возможность внесения модификаций, которых нет в природной ДНК. Модификация олигонуклеотидов происходит, например, путем присоединения флуорофоров. Флуорофоры - это химические соединения, способные повторно излучать свет при возбуждении светом. Это функциональная группа в молекуле, которая отвечает за ее флуоресцентные свойства. Модифицированные флуорофорами олигонуклеотиды используются в качестве флуоресцентно-меченых зондов (маркеров) для идентификации определенной последовательности в ДНК.

Олигонуклеотиды используются для решения задач в молекулярно-биологических исследованиях, включая секвенирование, ПЦР, генную терапию и другие генетические исследования, диагностику заболеваний, синтез белков и пр. Антисмысловые олигонуклеотиды, напротив, блокируют синтез белка, так как могут связываться с мРНК посредством комплементарного спаривания оснований.

Конечная цель многих исследований в области молекулярной биологии заключается в понимании функций генов и их регуляции. Синтез олигонуклеотидов необходим для того, чтобы достичь этой цели, и является надежным и эффективным инструментарием, который позволяет изучать ДНК и РНК на молекулярном уровне.

Компания Биолабмикс предлагает готовые олигонуклеотиды и синтез олигонуклеотидов на заказ. Готовые олигонуклеотиды – это смеси синтезированных случайных гексамеров и нонамеров, а также состоящий из дезокситимидина синтетический 18-мерный одноцепочечный ДНК олигонуклеотид, который гибридизуется с поли(А) 3’ концом мРНК.

Мы синтезируем на заказ высокоочищенные олигонуклеотиды в малых и больших масштабах — от нескольких наномолей для одного эксперимента до количества в несколько миллимолей. Неочищенные олигонуклеотиды могут содержать неудачные последовательности, поэтому рекомендуется их очистка. Такие методы, как ВЭЖХ и ПААГ, позволяют проводить разделение по длине. Контроль качества – важный этап синтеза, который проходит вся наша продукция. Мы проверяем чистоту произведенных олигонуклеотидов на хроматографе и масс-спектрометре, что гарантирует вам высокое качество поставляемой продукции.